Pénétration de micro-organismes (bactéries, virus, champignons, parasites) dans un organisme (par exemple animal ou humain) où ils s'installent dans des tissus spécifiques et prolifèrent. En fonction de la virulence (infection de la force des agents pathogènes), le montant de l'agent pathogène et la défense de l'infection de l'organisme à une maladie infectieuse, une infection non pathogène ou même un inoffensif ensemble (symbiose, comme avec la flore intestinale physiologique) est formé.